李宏俊， 40(1): 126−132. doi: 10.3969/j.issn.1673-9159.2020.01.017 [36] 杨青， et al. Fishery Resource Utilization in the Yellow Sea and East China Sea[M]. Shanghai: Shanghai Science and Technology Press， Ni Yong， Fukunaga T。
39(3): 23−29. [15] Sigsgaard E E， Li Hongbo， 41(1): 1−10. [10] 高天翔， Rey A， 2018.Zhou Yongdong， et al. Application and evaluation of environmental DNA technology in fish diversity research in Xiangshan Bay[J]. Journal of Fishery Sciences of China， 李长松。
陈云龙. 黄、东海渔业资源群落结构变化研究[J]. 渔业科学进展， 9(4): 1049−1059. doi: 10.1111/2041-210X.12951 [31] 刘勇， 2020， et al. Author correction: reproducible。
scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2[J]. Nature Biotechnology， 程家骅， 28(2): 205−214.Ling Jianzhong， 严利平. 东海大陆架鱼类群落的空间结构[J]. 生态学报。
et al. Detection of adult green sturgeon using environmental DNA analysis[J]. PLoS One， 等. 东海中部鱼类群落多样性的季节变化[J]. 海洋渔业， 2019， et al. The application of environmental DNA in the monitoring of the Yangtze finless porpoise。
a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species[J]. Royal Society Open Science， Li Shengfa. Atlas of Spawning Grounds， et al. Seawater environmental DNA reflects seasonality of a coastal fish community[J]. Marine Biology， 林佳艳。
Cao Yan， Chen Yunlong. Variations of fishery resource structure in the Yellow Sea and East China Sea[J]. Progress in Fishery Sciences， 马凌波， 李圣法， 李尚鲁， 2020， 27(11): 4377−4386. doi: 10.3321/j.issn:1000-0933.2007.11.001 [5] Liu J Y. Status of marine biodiversity of the China Seas[J]. PLoS One， Nishiuchi K， 2006， 李建林， 王晓艳. 近海鱼类多样性调查新方法—环境DNA分析技术[J]. 浙江海洋大学学报(自然科学版)， Overwintering Grounds， 孙鹏， Wang Weiji. Application of environmental DNA technology in aquatic ecosystem[J]. Progress in Fishery Sciences， 163(4148): 688. doi: 10.1038/163688a0 [27] Pielou E C. The measurement of diversity in different types of biological collections[J]. Journal of Theoretical Biology， 2019， 31(10): 19−24. doi: 10.3969/j.issn.1000-3096.2007.10.009 Liu Yong， 2018， 2007， 2020， Ma Lingbo， 2016， Zhang Qiuhua， 等. 环境DNA技术在象山港水域鱼类多样性调查中的应用与评估[J]. 中国水产科学， et al. Investigating the fish diversity in Erhai Lake based on environmental DNA metabarcoding[J]. Acta Hydrobiologica Sinica， 40(1): 59−64. doi: 10.6090/jarq.40.59 [7] 林龙山， 2021， 2020， 314(5800): 787−790. doi: 10.1126/science.1132294 [4] 李圣法， et al. Phylogenetic relationship of Thryssa inferred from morphologic characteristic and mitochondrial 16S rRNA gene sequences[J]. Journal of Fishery Sciences of China。
Bouquieaux M C。
Das S K. Effects of elevated carbon dioxide on marine ecosystem and associated fishes[J]. Thalassas: An International Journal of Marine Sciences。
2015。
2005， 姜亚洲， Griffiths J， et al. The structure and diversity of demersal fish communities in winter 2000 in the East China Sea and the Yellow Sea[J]. Marine Science， Herzog C， 2016， 张秋华， Beaumont N， Wang Xiaoyan. Environmental DNA， Rideout J R， Xian Weiwei. Application of environmental DNA technology in ecological conservation and monitoring[J]. Marine Science， 程家骅， 李苗， 2006， 2019， et al. A possible collaboration with China on marine ecosystem research in the East China Sea[J]. Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ， 11(4): 265−270. [24] Shannon C E. A mathematical theory of communication part I: discrete noiseless systems[J]. The Bell System Technical Journal， et al. MiFish， Carl H， 2006.Cheng Jiahua。
Sato Y， Schumer G， 35(2): 421−429. doi: 10.1007/s41208-019-00161-3 [3] Worm B， Cheng Jiahua， 11(4): e0153500. doi: 10.1371/journal.pone.0153500 [30] Lugg W H， 2019， 1984， 2016， 2015。
1966。
a new method for fish diversity investigation in the coastal waters[J]. Journal of Zhejiang Ocean University (Natural Science Edition)。
interactive， 1948。
17(3): 471−477. [34] 程家骅， 王伟继. 环境DNA(eDNA)技术在水生生态系统中的应用研究进展[J]. 渔业科学进展， 13: 131−144. doi: 10.1016/0022-5193(66)90013-0 [28] 赵淑江， Chen Quanzhen， 2007。
37(1): 1−7. [11] 张辉， 陈治， 2018. [39] 李圣法， Nielsen I B， 等. 基于线粒体COⅠ基因的中国近海棱鳀属鱼类DNA条形码[J]. 水产学报。
曹艳， amplification and sequencing of DNA from environmental samples[J]. New Zealand Journal of Ecology， 8(1): e50719. doi: 10.1371/journal.pone.0050719 [6] Takayanagi K， 2020， 徐源。
Yokouchi K， et al. Marine water environmental DNA metabarcoding provides a comprehensive fish diversity assessment and reveals spatial patterns in a large oceanic area[J]. Ecology and Evolution， 等. 海洋生物多样性评价方法综述[J]. 海洋环境科学， 2006. [35] 杜萍， et al. Towards a multidimensional view of biodiversity and ecosystem functioning in a changing world[J]. New Phytologist。
程家骅， 2007。
40(1): 126−132. doi: 10.3969/j.issn.1673-9159.2020.01.017 Du Ping， 2020， 2019， 40(10): 1513−1520. [33] 马春艳， 2017. [38] 周永东， 线薇薇. 环境DNA技术在生态保护和监测中的应用[J]. 海洋科学。
等. 东黄海渔业资源利用[M]. 上海: 上海科学技术出版社， 2020， 2018， 26(1): 124−132. doi: 10.3724/SP.J.1118.2019.18133 [13] Lear G， 2020， Zhang Qun， Xu Yuan， 2010， 2015， et al. Review on assessment methods of marine biodiversity[J]. Marine Environmental Science， 2005， 1949， 164(6): 128. doi: 10.1007/s00227-017-3147-4 [16] Fraija-Fernández N， Li Huiyu. Recent status of bottom trawl fishery resources in the East China Sea[J]. Modern Fisheries Information， 2017， et al. Seasonal changes on fish community diversity in the middle part of the East China Sea[J]. Marine Fisheries， Lü Baoqiang。
40(10): 1513−1520.Gong Yayun， 26(1): 124−132. doi: 10.3724/SP.J.1118.2019.18133 Wu Yunsheng。
2019， 15(12): e0244495. doi: 10.1371/journal.pone.0244495 [20] Miya M， 等. 基于形态特征和线粒体16S rRNA基因序列探讨棱鳀属的系统进化[J]. 中国水产科学， Lu Guoqing， et al. A preliminary analysis of fishery resource exhaustion in the context of biodiversity decline[J]. Science China: Earth Sciences， 44(5): 1080−1086. doi: 10.7541/2020.125 [19] Wang Xiaoyan， 27(3): 379−423. doi: 10.1002/j.1538-7305.1948.tb01338.x [25] Shannon C E. A mathematical theory of communication part II: the discrete channel with noise[J]. The Bell System Technical Journal， Banks J， Jiang Yazhou， Sun Peng。
2018， Li Ruwei， 1948， 45(11): 1628−1640. [29] Bergman P S， 2013， 2007， 26(4): 796−810. [9] 戴芳群， et al. Assessment of fishery resources using environmental DNA: small yellow croaker (Larimichthys polyactis) in East China Sea[J]. PLoS One， 2018。
2020， 32(1): 157−160.Yang Qing， 倪勇， 2013， 17(3): 471−477.Ma Chunyan。
李圣法， Li Hongjun， Cheng Jiahua， Saghaï A， 32(1): 157−160. [37] 赵梦迪. 利用环境DNA分析冬季中国东黄海水域的鱼类多样性[D]. 上海: 上海海洋大学， 28(2): 205−214. [18] 舒璐。
李圣法. 东海区主要经济种类三场一通道及保护区图集[M]. 北京: 海洋出版社， 朱玲， 陈学刚。
26(4): 796−810.Liu Yong， Barbier E B， et al. Impacts of biodiversity loss on ocean ecosystem services[J]. Science， Feeding Grounds， Dickie I。
2010， Tang Yongkai， Chen Zhi， Li Changsong， Lin Jiayan， Cheng Jiahua. Preliminary analysis on the division of fishery resources based on hydrological environment factors in the East China Sea and south of the Yellow Sea[J]. Journal of Fishery Sciences of China， 31(10): 19−24. doi: 10.3969/j.issn.1000-3096.2007.10.009 [32] 宫亚运， Zhu Ling， Li Shengfa， et al. Advances in the Trichiurus lepturus changes and habitat driving factors in the East China Sea[J]. Journal of Guangdong Ocean University， 42(1): 10. [14] 单秀娟， 2017.Zhao Mengdi. Analysis of the fish diversity of the East China Sea and the Yellow Sea in winter using environmental DNA[D]. Shanghai: Shanghai Ocean University， et al. Methods for the extraction， 27(2): 113−119. doi: 10.3969/j.issn.1004-2490.2005.02.005 Li Shengfa。
27(11): 4377−4386. doi: 10.3321/j.issn:1000-0933.2007.11.001 Li Shengfa。
2020， Cheng Jiahua， 1972。
Dillon M R， 39(3): 23−29.Shan Xiujuan， Blankenship S， et al. DNA barcoding of Thryssa in coastal waters of China based on the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I sequence[J]. Journal of Fisheries of China， 37(9): 1091. [22] Whittaker R H. Evolution and measurement of species diversity[J]. Taxon， Li Miao， 李惠玉. 东海底拖网渔业资源现状[J]. 现代渔业信息， 21(9): 13−15.Lin Longshan。
Chen Xuegang， 陈全震， Neophocaena phocaenoides asaeorientalis[J]. Journal of Fishery Sciences of China， 等. 物种灭绝背景下东海渔业资源衰退原因分析[J]. 中国科学: 地球科学， 27(3): 623−656. [26] Simpson E H. Measurement of diversity[J]. Nature， 37(1): 1−7.Gao Tianxiang， Li Shengfa， 等. 东海带鱼资源变动及其栖息地驱动因子研究进展[J]. 广东海洋大学学报， 2(7): 150088. doi: 10.1098/rsos.150088 [21] Bolyen E， et al. Optimal survey designs for environmental DNA sampling[J]. Methods in Ecology and Evolution， 21(2/3): 213−251. [23] Chao Anne. Nonparametric estimation of the number of classes in a population[J]. Scandinavian Journal of Statistics。
程家骅. 东海及黄海南部渔业资源水文环境类群划分及其相关特征的初步分析[J]. 中国水产科学， 2021， 45(11): 1628−1640.Zhao Shujiang， 章群。
44(5): 1080−1086. doi: 10.7541/2020.125 Shu Lu， 41(1): 1−10.Dai Fangqun， 2018， 228(3): 820−822. doi: 10.1111/nph.16881 [2] Noor N M， 21(9): 13−15. [8] 刘勇。
等. 环境DNA在长江江豚监测中的应用[J]. 中国水产科学， 2020。
吕宝强， 等. 东、黄海2000年冬季底层鱼类群落结构及其多样性[J]. 海洋科学， 2006， 44(7): 96−102. doi: 10.11759/hykx20200119002 [12] 吴昀晟， 唐永凯， 27(2): 113−119. doi: 10.3969/j.issn.1004-2490.2005.02.005 ， 2006， Yan Liping. Spatial structures of fish communities on the continental shelf of the East China Sea[J]. Acta Ecologica Sinica， [1] Edlinger A， Zhao Linlin， Li Shanglu， 等. 基于环境DNA宏条形码的洱海鱼类多样性研究[J]. 水生生物学报， 李洪波， 2013， Migratory Channels and Protected Areas of the Main Economic Species in the East China Sea[M]. Beijing: China Ocean Press， 李汝伟， storage，。
2018， Li Jianlin， Van Rooyen A R， 10(14): 7560−7584. doi: 10.1002/ece3.6482 [17] 凌建忠， 44(7): 96−102. doi: 10.11759/hykx20200119002 Zhang Hui。